EMAs saadud rakenduslik kõrgharidus mehaanika- ja laevandusteaduskonnas annab võimaluse töötada piiramatu kogumahutavusega ja piiramatu peamasina võimsusega laevade vanem-juhtivkoosseisus. Laevandusteaduskonnas on võimalik omandada tüürimehe eriala ning mehaanika teaduskonnas laeva jõuseadmete või külmutusseadmete eriala.

EMA lõpetanud laevaohvitseride tase on leidnud tunnustust mitmes Euroopa mereriigis (Holland, Taani, Saksamaa). Kevadel 2008 kontrollis laevaohvitseride siinset väljaõpet autoriteetne rahvusvaheline audiitorkomisjon, kelle töö tulemusena väljastati Akadeemiale Lloyd'i Registri tunnistus (sertifikaat), mis tunnistab väljaõppe vastavust rahvusvahelise merendusorganisatsiooni IMO (International Maritime Organization) nõuetele ja on kõrge rahvusvaheline tunnustus.

Merendusteaduskonna (õppeaeg 4 a) lõpetanu saab vastava õppekava täies mahus läbimist tõendava rakenduskõrghariduse diplomi ning saab vastavalt lõpetatud erialale töötada erinevates merendusega seotud ettevõtetes. Merendusteaduskonnas on võimalik spetsialiseeruda järgmistele valdkondadele: sadamamajandamine ja meretranspordi juhtimine, hüdrometeoroloogia ja loodushoid, hüdrograafia, kalatoodete tehnoloogia, kalandusspetsialist.

Et EMA lõpetanu saab teadusel põhineva, kuid praktikale suunatud kõrghariduse, on õppekavades ette nähtud praktilised ja laboratoorsed tööd. Tulevaste spetsialistide ettevalmistamisel on oluline roll spetsiaalsisseseadega õppeklassidel, õppetöökodadel ja erialalaboritel. Auditooriumites ja kooli laborites ning õppetöökodades omandatu kinnistatakse meresõidu- või ettevõttepraktikaga. Praktika läbiviimiseks on sõlmitud mitmeid kokkuleppeid Eesti, Hollandi jt riikide laevandusfirmade, sadamate ning teiste merendusettevõtetega.

Pärast EMA rakenduskõrghariduse omandamist on võimalik jätkata oma õpinguid EMA magistriõppes.